内科のメモ帳

• Grammer of Graphics による記載．
  • グラフの要素を重ねるようにして記載していく
• データ，グラフの形，軸をそれぞれ指定する

+ labs("タイトルラベル", "X軸ラベル", "Y軸ラベル")

• 具体例

ggplot(msleep, aes(X, Y) +   #ggplotで読み込むデータセット，x軸，y軸指定
  geom_point(aes(shape=Z, color=Z)) +    #散布図を指定，形と色を決める変数も指定
  labs(title = "XとYの関係",   #タイトルの指定
       x = "X[(kg)]",        #x軸ラベルの指定
       y = "Y[時間]")         #y軸ラベルの指定

• X軸が長すぎる名前のときなど，以下のように回転させれば解決できる

+scale_x_discrete(guide = guide_axis(angle=45))

• 凡例 = Legend
• 凡例ラベルは以下のようにして指定する

scale_color_discrete(
  name ="その凡例ラベルの名前"  #diamond の例であれば clarity など
  labels ="それぞれのカテゴリに対応した名前"  #clarity だと I1,SI2,SI1,VS2,VS1,VVS2,VVS1,IFの7段階
  breaks ="上記のカテゴリのレベル"           #どの順で提示するかを指定する
  )

• colorではなくfillを使って凡例表示をしているときは，

  scale_fill_discrete()

• guide=FALSE を入れれば凡例ラベル自体を消すことも可能

+ scale_fill_discrete(guide = FALSE)

+theme_bw()
+theme_classic()
+theme_dark()
+theme_gray()
+theme_light()
+theme_linedraw()
+theme_minimal()

• 色々見た目があるので，好きにいじればよい
  • themeは最後の行の実行で上書きしていくスタイルになるので，上記のような固定テーマは最初に指定した上で，凡例の位置を調整するとよい
  • 逆パターンだと，凡例ラベルの位置を調整しても，固定テーマによって所定の位置に上書きされる
• パッケージで “ggthemes” を入れると，さらに選択の幅が広がる

install.packages("ggthemes")
library(ggthemes)

+ theme(legend.position = "bottom")   #凡例を下に
+ theme(legend.position = "right")    #凡例を右に（初期設定）
+ theme(legend.position = "top")      #凡例を上に
+ theme(legend.position = "left")     #凡例を左に

+ theme(legend.position = c(1,1))      #凡例を右上に
+ theme(legend.position = c(0.5,0.5))  #凡例をグラフのど真ん中に（邪魔）
+ theme(legend.position = c(0,0))      #凡例を左下に

• 以下は具体的なコード

• 初めから入っている “diamonds” のデータセットを用いる
• 以下のようにすればX軸にカラット数，Y軸に値段，色をダイヤのカラーで指定できる
  • aes は aesthtetic に由来する

ggplot(data = diamonds) + 
  geom_point(
    mapping = aes(x = carat,y = price,color = color)
  )

• 同じことは以下のようにも指定できる

gg <- ggplot(diamonds, aes(carat, price))
gg + geom_point(aes(color = cut))

• なお散布図などでは，shape=() を使うことでプロットの点を分類することも可能
  • factor型の変数に用いることを推奨（形の種類は限られるため）

• ダイアモンドの色と値段の関係を箱ヒゲ図にする場合，以下のようにする

gg <- ggplot(diamonds, aes(color, price))
gg + geom_boxplot(aes(fill=clarity, color = clarity))

• fillは箱の塗りつぶし，colorは外枠の色．同じもので指定すれば塗りつぶしになる